Cục Bảo vệ thực vật
Cục Bảo vệ thực vật ngày nay, tiền thân là Cục Bảo vệ và kiểm dịch thực vật được thành lập ngày 05 tháng 10 năm 1961 theo Nghị định số 152/CP của Hội đồng Chính phủ.
Viện Bảo Vệ Thực Vật
Viện có 117 cán bộ trong biên chế, trong đó có: 27 Tiến sĩ; 65 Thạc sĩ; 22 Đại học và 3 nhân viên kỹ thuật phục vụ.
Viện Thổ nhưỡng Nông hóa
Viện Thổ nhưỡng Nông hóa là đơn vị sự nghiệp khoa học công lập trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp VN (VAAS), có chức năng nghiên cứu khoa học, chuyển giao công nghệ và sản xuất kinh doanh về lĩnh vực đất, phân bón và vi sinh vật trên phạm vi cả nước.
Viện Khoa học kỹ thuật nông lâm nghiệp miền núi phía Bắc
Viện khoa học kĩ thuật nông lâm nghiệp miền núi phía Bắc, được thành lập theo Quyết định số 220/2005/QĐ-TTg ngày 09/9/2005 của thủ tướng Chính phủ và Quyết định số 3407/QĐ-BNN-TCCB ngày 05/12/2005 của Bộ trưởng Bộ nông nghiệp và PTNT ; Viện có tiền thân từ Trạm Nghiên cứu Nông lâm nghiệp Phú Thọ do người Pháp thành lập năm 1918.
Trung tâm Chuyển giao công nghệ và Khuyến nông
Trung tâm Chuyển giao công nghệ và Khuyến nông trực thuộc Viện Khoa học nông nghiệp Việt Nam. Hiện nay Trung tâm là một trong 18 đơn vị trực thuộc và là đầu mối chuyển giao công nghệ & khuyến nông của Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam.